ANALYSIS OF THE GENETIC STRUCTURE OF SEVEN GENE POOL POPULATIONS OF CHICKENS
Abstract
The purpose of this study was to determine the main population-genetic specifics in groups of chickens of seven breeds and populations. To achieve this goal, a multilocus genetic analysis with a labeled oligonucleotide probe (GTG)5 was used. In particular, genetic connection was revealed in groups of chickens in accordance with the criterion of genetic distance. Intrapopulation diversity in the breeds was evaluated using average heterozygosity. The presence of specific DNA fragments allowed to offer them as markers for individual breeds. Low biodiversity was established in the population of Russian white, which corresponds to intensive breeding and selection in this group carried out over many generations.
Full text is available in pdf only
References
Тыщенко В.И. Оценка генетического разнообразия в популяциях кур на основе геномной дактилоскопии / В.И. Тыщенко, Н.В. Дементьева, В.П. Терлецкий и др. // Сельскохозяйственная биология. – 2002. – № 6. – С. 43–46.
Яковлев А.Ф. Влияние гена гормона роста на хозяйственные признаки птицы / А.Ф. Яковлев, В.П. Терлецкий, Э.А.Сексте и др. // Птицеводство. – 2013. – №1. – С. 2–4.
Яковлев А.Ф. Использование полиморфизма ДНК и генов в селекции сельскохозяйственных животных / А.Ф. Яковлев, В.П. Терлецкий, В.И. Тыщенко и др. // Современные методы генетики и селекции в животноводстве: материалы международной научной конференции 26-28 июня 2007 г. Санкт-Петербург, Пушкин, ВНИИГРЖ. – г. Санкт-Петербург–Пушкин, 2007. – С.18–23.
Дементьева Н.В. Встречаемость и значение мутации CVM у племенных животных Ленинградской области / Н.В. Дементьева, О.В. Митрофанова, В.И. Тыщенко и др. // Молочное и мясное скотоводство. – 2014. – №6. – С.5–7
Terletsky V.P. An efficient method for genetic certification of Bacillus subtilis strains, prospective producers of biopreparations / V.P. Terletsky, V.I. Tyshchenko, I.I. Novikova et al. // Microbiology. – 2016. – V. 85. – no 1. – pp. 71–76. DOI: 10.7868/S0026365616010134
Kiselyova T.Y. Linkage disequilibrium analysis for microsatellite loci in six cattle breeds / T.Y. Kiselyova, V.P. Terletsky, J. Kantanen et al. // Russian Journal of Genetics. – 2014. – V. 50. – № 4. – pp. 406–414.
Duitama J. Large-scale analysis of tandem repeat variability in the human genome / J. Duitama, A. Zablotskaya, R. Gemayel et al // Nucleic Acids Res. – 2014. – Vol. 42. – pp. 5728–5741.
Vergnaud G. Minisatellites: mutability and genome architecture / G. Vergnaud, F. Denoeud // Genome Res. – 2000. – Vol.10(7). – pp. 899–907. DOI: 10.1101/gr.10.7.899.
Marzieh E.R. Genome-wide characterization of human minisatellite VNTRs: population-specific alleles and gene expression differences / E.R. Marzieh , Y. Hernández, S.D. Drinan et al. // Nucleic Acids Research. – 2021. – Vol. 49. – no 8. – pp. 4308–4324. DOI: 10.1093/nar/gkab224
Legendre M. Sequence-based estimation of minisatellite and microsatellite repeat variability / M. Legendre, N. Pochet, T. Pak et al. // Genome Res. – 2007. – Vol.17. – pp.1787–1796.
Митрофанова О.В. Связь генотипов по однонуклеотидным заменам в гене миостатина с показателями живой массы у кур юрловской породы / О.В. Митрофанова, Н.В. Дементьева, В.И. Тыщенко и др. // Генетика и разведение животных. – 2015. – № 1. – С. 39–42.
Stephens J.C. Estimation of heterozygosity for single-probe multilocus DNA fingerprints / J.C. Stephens, D.A. Gilbert, N. Yuhki et al. // Mol. Biol. Evol. – 1992. – V.9. – pp.729–743.
Ksiazek K. IL4 gene VNTR polymorphism in chronic periodontitis in end-stage renal disease patients / K. Ksiazek, J. Blaszczak, M. Buraczynska // Oral Dis. – 2019. –. Vol. 25. – pp. 258–264.
Cui J. Differences of variable number tandem repeats in XRCC5 promoter are associated with increased or decreased risk of breast cancer in BRCA gene mutation carriers / J. Cui, J. Luo, Y.C. Kim et al. // Front. Oncol. – 2016. – Vol 6. – p. 92.