ПЦР ИДЕНТИФИКАЦИЯ И ХАРАКТЕРИСТИКА ФЕРМЕНТАТИВНОЙ АКТИВНОСТИ И АНТАГОНИСТИЧЕСКИХ СВОЙСТВ БАКТЕРИЙ РОДА PSEUDOMONAS ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ПРИРОДНЫХ ИСТОЧНИКОВ
Аннотация
Проведена молекулярно-генетическая идентификация штаммов бактерий рода Pseudomonas, выделенных из почвы и травянистой части растений картофеля (Solanum tuberosum). ПЦР-анализ с использованием родоспецифичного праймера OpriF/OpriR показал, что 9 образцов чистой культуры бактерий характеризовались наличием одного ампликона, характерного для бактерий рода Pseudomonas. Принадлежность отобранных бактерий к роду Pseudomonas подтверждена сравнительным анализом секвенированной нуклеотидной последовательности гена 16S рРНК с референтными нуклеотидными последовательностями типовых штаммов из базы данных RDP. Установлены широкий спектр ферментативной активности и выраженные антагонистические свойства в отношении фитопатогенных микромицетов родов Alternaria и Fusarium у отобранных штаммов бактерий.
Полный текст только в pdf
Список литературы
Maren L. Friesen Microbial Mediated Plant Functional Traits. [Electronic resource] / Maren L. Friesen, Stephanie S. Porter, Scott C. Stark and others // Friesen Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics. – 2011. - Vol. 42. - P. 23-
– Mode of access: https://doi.org/10.1146/annurev-ecolsys-102710-145039 . – Date of access: 20.02.2019.
Dessaux Y. Engineering the Rhizosphere. / Y. Dessaux, C. Grandclément, D. Faure // Trends in Plant Science. – 2016. Vol. 21, № 3. – P. 266-278.
Paterson J. The contribution of genome mining strategies to the understanding of active principles of PGPR strains. [Electronic resource] / J. Paterson, Ghazaleh Jahanshah, Yan Li and others // FEMS Microbiol Ecol. - 2017. – Article number:
– P. 1–31. – Mode of access: https://doi.org/10.1093/femsec/fiw249. - Date of access: 20.02.2019.
Vakhitov T. Y. Regulyatornyye funktsii bakterial'nykh ekzometabolitov na vnutripopulyatsionnom i mezhvidovykh urovnyakh: [Regulatory functions bacterial ehkzometabolitov at intrapopulation and interspecific levels]: dis. of PhD in Biology sciences: 03.00.23 defense of the thesis: 20.04.07 / VakhitovTimur Yashevich.- 2007. - 561 p. [in Russian]
Silby M.W. Pseudomonas genomes: diverse and adaptable / Silby M. W., Winstanley C., Godfrey S. A. and others // FEMS Microbiol Rev. – 2011. – Vol. 35. – P.652–680.
Sitaraman R. Pseudomonas spp. as models for plant-microbe interactions // Front. Plant Sci. – 2015. – Vol. 6, article 787.
- Mode of access: https://doi.org/10.3389/fpls.2015.00787. - Date of access: 20.02.2019.
Gholami, A. PCR-based assay for the rapid and precise distinction of Pseudomonas aeruginosa from other Pseudomonas species recovered from burns patients / A. Gholami, A. Majidpour, M. Talebi-Taher and others // J PREV MED HYG. – 2016. Vol.57. – P.81-85.
Metody pochvennoy mikrobiologii [Methods of soil microbiology] / Segi Y. – M.: Kolos, 1983.– 253 с. [in Russian]
Tamás L. Effect of carboxymethyl chitin-glucanon the activity of some hydrolytic enzymes in maize plants. / L. Tamás,
J. Huttová, I. Mistrík and others // Chem. Pap. – 2002. Vol. 56, № 5. - P. 326—329.
Shrivastava R. Metabolism and Preferential Utilization of Phenylacetic acid and 4-Hydroxyphenylacetic Acid in Pseudomonas putida CSV86. / R. Shrivastava, H. Purohit, PS. Phale // J. Bioremed Biodegrad. - 2011. - Vol. 2:- P. 2-7.
Mohamed M. Aerobic metabolism of phenylacetic acids in Azoarcus evansii. / M. Mohamed, W. Ismail, J. Heider and others // Arch Microbiol. - 2002. - Vol. 178. P. 180-192.
Luengo, J. The Catabolism of Phenylacetic Acid and Other Related Molecules in Pseudomonas putida. / J. I. Jiménez, Nogales, J. L. García // Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology. - 2007. - P. 1297-1325.