Вернуться к статье

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МЕТОДА ПОЛНОГЕНОМНОГО АССОЦИАТИВНОГО ИССЛЕДОВАНИЯ В СЕЛЕКЦИИ СВИНЕЙ

Таблица 1 - Структурная аннотация достоверно выявленных SNP по признаку среднесуточного прироста

№хр.

SNPПозиция

Р

ГенПротяженность

1

WU_10.2_1_180284104162 607 316

 

6,15E-07

NEDD4L162364053..162736515

3

ALGA0116500127 464 779

3,17E-06

KIDINS220127382587..127477753

4

ASGA002096992 646 954

0,000224

MBOAT2127243797..127365443

ASGA002098392 939 481

ID2127500759..127503207

ASGA002098993 062 179

ETV392964808..92979129

ASGA002099093 081 498

ETV3L93005259..93011259

4_10162428792 954 515

0,00019

ARHGEF1193045533..93160756

ALGA002683593 017 369

0,000224

PEAR193178854..93205186

ALGA002687193 492 857

NAXE93493234..93495912

MARC002582692 994 199

LRRC7193162453..93176013

WU_10.2_4_10241932793 717 288

0,000152

NTRK193219509..93237944

INSRR93239678..93258075

PRCC93297859..93325499

HDGF93341081..93351809

METTL25B93358140..93366169

ISG20L293366188..93372407

MRPL2493352997..93357805

SH2D2A93282383..93293214

CRABP293388198..93393861

NES93412660..93421899

IQGAP393495999..93556915

HAPLN293462306..93468394

BCAN93432331..93450895

GPATCH493486365..93492837

TTC2493500900..93512039

MEF2D93581563..93616980

ALGA002693194786666

8,55E-05

GBA194583905..94606689

ALGA00269379 4908711

8,55E-05

MUC194626317..94631194

M1GA000613694920625

8,55E-05

MTX194606576..94611439

M1GA000613994952966

8,55E-05

TRIM4694632073..94642756

MARC004704394995753

5,27E-05

THBS394612702..94623905

MARC005106194385015

8,55E-05

KRTCAP294643300..94646436

MARC009309394339347

8,55E-05

SLC50A194663057..94665486

EFNA194666457..94673442

DPM394661568..94662223

EFNA394709941..94719350

DCST194748430..94768322

ADAM1594736639..94748093

EFNA494730790..94735578

PMVK94861500..94913743

PBXIP194837365..94847652

FLAD194807280..94813512

SHC194818226..94831766

DCST294768533..94781482

PYGO294832279..94836548

LENEP94805409..94807175

CKS1B94815769..94819583

DBWU000096096207274

0,000156

CHTOP95996030..96006511

S100A196007026..96012305

GATAD2B95766989..95864502

INTS395904072..95944805

SLC27A395898780..95903599

S100A1396007280..96025120

SNAPIN95987524..95989527

S100A1696030930..96038602

NPR195957220..95974253

ILF295980862..95987568

S100A1496027746..96029878

S100A596093204..96096870

S100A296073496..96076825

S100A496088102..96091160

S100A396084049..96086829

S100A696098264..96099686

S100A796176718..96178694

5

H3GA001585617163494

0,000142

SLC4A816842667..16921669

SCN8A16977468..17173831

9

ASGA0044888129535988

3,02E-05

PTPN14129114668..129248898

DRGA0009891128247578

0,000106

PLA2G4A127853581..128164825

WU_10.2_9_142385342129688707

0,00021

SMYD2129263524..129316226

PROX1129527704..129583693

13

ALGA006793210415894

1,64E-05

UBE2E29998097..10380564

ASGA005636915586736

9,42E-06

RBMS314968921..16458470

ALGA009741821938080

8,36E-05

GRM820945049..21756952

WU_10.2_18_4622045842107509

0,0001513

ITPRID141491840..41768828

NEUROD641757356..41763837

ADCYAP1R141915180..41972327

GHRHR42030505..42046178

AQP142063482..42076741

MINDY442096351..42202511

жирным шрифтом выделены гены, внутри которых локализован выявленный SNP; №хр. – номер хромосомы; SNP – однонуклеотидный полиморфизм; Р – достоверность выявленного SNP