ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МЕТОДА ПОЛНОГЕНОМНОГО АССОЦИАТИВНОГО ИССЛЕДОВАНИЯ В СЕЛЕКЦИИ СВИНЕЙ
Таблица 1 - Функциональная аннотация генов, ассоциированных с выявленными SNP
№ хр. | Ген | DAVID (GOTERM_BP) | Pig QTL |
1 | NEDD4L | нет | QTL:169088 |
3 | KIDINS220 | сигнальный путь фактора роста нервов | нет |
MBOAT2 | модификация липидов | нет | |
ID2 | регуляция процессов липидного обмена, двигательный ритм, развитие альвеол молочной железы | нет | |
4 | NAXE | транспорт липидов, регулирование оттока холестерина | нет |
NTRK1 | развитие многоклеточного организма, развитие нервной системы | нет | |
INSRR | развитие многоклеточного организма, определение мужского пола | нет | |
CRABP2 | транспорт жирных кислот, эмбриональный морфогенез передних конечностей | нет | |
HAPLN2 | развитие костной системы, развитие центральной нервной системы | нет | |
BCAN | развитие костной системы, центральной нервной системы | нет | |
MEF2D | развитие сердца | нет | |
GBA1 | метаболический процесс, морфогенез мозга, нервно-мышечный процесс | нет | |
THBS3 | развитие хрящевой пластинки, окостенение | нет | |
DCST1 | слияние сперматозоида с плазматической мембраной яйцеклетки, участвующей в однократном оплодотворении, распознавание сперматозоидов и яйцеклеток | нет | |
ADAM15 | врожденный иммунный ответ, переход от эпителия сердца к мезенхиме, иммунный ответ на опухолевую клетку, | нет | |
PBXIP1 | кроветворение, развитие суставного хряща | нет | |
SHC1 | ангиогенез, развитие сердца | нет | |
PYGO2 | развитие почек | нет | |
S100A1 | регуляция сердечных сокращений | нет | |
SLC27A3 | процесс метаболизма длинноцепочечных жирных кислот | нет | |
S100A14 | реакция на липополисахарид | нет | |
S100A6 | клеточный ответ на вирус | нет | |
SCN8A | нет | QTL:160641; QTL:160642 | |
9 | PTPN14 | нет | нет |
PLA2G4A | процесс метаболизма глицерина, процесс метаболизма арахидоновой кислоты | нет | |
PROX1 | развитие почек, развитие легких | QTL:179339 | |
13 | RBMS3 | защитный ответ на опухолевую клетку | QTL:23467 |
18 | GRM8 | нет | QTL:19443; QTL:264227 |
NEUROD6 | развитие нервной системы, развитие органов чувств | нет | |
GHRHR | нет | QTL:1186; QTL:1192; QTL:1191 |
жирным шрифтом выделены гены, внутри которых локализован выявленный SNP