Вернуться к статье

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МЕТОДА ПОЛНОГЕНОМНОГО АССОЦИАТИВНОГО ИССЛЕДОВАНИЯ В СЕЛЕКЦИИ СВИНЕЙ

Таблица 1 - Функциональная аннотация генов, ассоциированных с выявленными SNP

№ хр.

Ген

DAVID (GOTERM_BP)

Pig QTL

1

NEDD4L

нет

QTL:169088

3

KIDINS220

сигнальный путь фактора роста нервов

нет

MBOAT2

модификация липидов

нет

ID2

регуляция процессов липидного обмена, двигательный ритм, развитие альвеол молочной железы

нет

4

NAXE

транспорт липидов, регулирование оттока холестерина

нет

NTRK1

развитие многоклеточного организма, развитие нервной системы

нет

INSRR

развитие многоклеточного организма, определение мужского пола

нет

CRABP2

транспорт жирных кислот, эмбриональный морфогенез передних конечностей

нет

HAPLN2

развитие костной системы, развитие центральной нервной системы

нет

BCAN

развитие костной системы, центральной нервной системы

нет

MEF2D

развитие сердца

нет

GBA1

метаболический процесс, морфогенез мозга, нервно-мышечный процесс

нет

THBS3

развитие хрящевой пластинки, окостенение

нет

DCST1

слияние сперматозоида с плазматической мембраной яйцеклетки, участвующей в однократном оплодотворении, распознавание сперматозоидов и яйцеклеток

нет

ADAM15

врожденный иммунный ответ, переход от эпителия сердца к мезенхиме, иммунный ответ на опухолевую клетку,

нет

PBXIP1

кроветворение, развитие суставного хряща

нет

SHC1

ангиогенез, развитие сердца

нет

PYGO2

развитие почек

нет

S100A1

регуляция сердечных сокращений

нет

SLC27A3

процесс метаболизма длинноцепочечных жирных кислот

нет

S100A14

реакция на липополисахарид

нет

S100A6

клеточный ответ на вирус

нет

SCN8A

нет

QTL:160641; QTL:160642

9

PTPN14

нет

нет

PLA2G4A

процесс метаболизма глицерина, процесс метаболизма арахидоновой кислоты

нет

PROX1

развитие почек, развитие легких

QTL:179339

13

RBMS3

защитный ответ на опухолевую клетку

QTL:23467

18

GRM8

нет

QTL:19443; QTL:264227

NEUROD6

развитие нервной системы, развитие органов чувств

нет

GHRHR

нет

QTL:1186; QTL:1192; QTL:1191

жирным шрифтом выделены гены, внутри которых локализован выявленный SNP