МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ ТИПИРОВАНИЕ КАК ИНСТРУМЕНТ ЭПИЗООТОЛОГИЧЕСКОГО КОНТРОЛЯ В ЖИВОТНОВОДСТВЕ
Аннотация
Изложены возможности использования молекулярно-генетических методов в профилактике инфекционных заболеваний путем быстрой и точной идентификации возбудителя. Данная задача решается генотипированием микроорганизма, при котором сравниваются генотипы бактериальных изолятов. Другим важным направлением использования генотипирования в животноводстве является выявление генов, определяющих антибиотикорезистентность. Разработанный метод генотипирования позволяет выявить пути распространения патогенных штаммов E.coli у кур в полевых условиях. Метод можно рекомендовать для решения вопросов эпидемиологии и эпизоотологии, генетической паспортизации бактериальных штаммов. Предложенный метод носит универсальный характер, так как может быть адаптирован практически к любому микроорганизмe. В этом случае необходимо подобрать пару ферментов рестрикции, которые были бы совместимы в одном реакционном буфере и обеспечили детекцию небольшого числа фрагментов ДНК на фильтре.
Полный текст только в pdf
Список литературы
Bikandi J. In silico analysis of complete bacterial genomes: PCR, AFLP-PCR and endonuclease restriction / J. Bikandi, R. San Millan, A. Rementeria, J. Garaizar // Bioinformatics. – 2004. – V. 20. – № 5. – P.798-799.
Terletskiy V. Validation of Double Digest Selective Label database for sequenced prokaryotic genomes / V. Terletskiy, V. Tyshchenko, I. Martinez-Ballesteros, J.Bikandi, J.Garaizar // Bioinformatics. – 2010. – V. 26. – P.417–418.
Van Belkum A. Guidelines for the validation and application of typing methods for the use in bacterial epidemiology / A. Van Belkum // Clin. Microbial. Infect. – 2007. – V. 13. – Suppl. 3. – P.1–46.
Rumore J.L. The Impact of Multilocus Variable-Number Tandem-Repeat Analysis on PulseNet Canada Escherichia coli O157:H7 Laboratory Surveillance and Outbreak Support, 2008-2012 / J.L. Rumore, L. Tschetter, C. Nadon // Foodborne Pathog Dis. – 2016. – V.13. – No5. – P.255–261. doi: 10.1089/fpd.2015.2066.
Yildirim I.H. N. Molecular methods for bacteria genotyping and analyzed gene regions / I.H. Yildirim, S.C. Yildirim, N. Kosak // Journal of Microbiology and Infectious Diseases. – 2011. – V.1. – No1. – P. 42–46.
Lartigue M.F. Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry for bacterial strain characterization / M.F. Lartigue // Infect. Genet. Evol. – 2013. – V.13. – P.230-235.
Minharro S. Biotyping and genotyping (MLVA16) of Brucella abortus isolated from cattle in Brazil, 1977 to 2008 / S. Minharro, J.P. Silva, E.M. Dorneles, R.B. Pauletti, H. Neubauer, F. Melzer, F.P. Poester, M.G. Dasso, E.S. Pinheiro, P.M. Soares, R.L. Santos, M. Heinemann A.P. Lage // PLoS ONE. – 2013. – V.8. – No12. DOI:10.1371/journal.pone.0081152.
Turki Y. Comparison of five molecular subtyping methods for differentiation of Salmonella Kentucky isolates in Tunisia / Y. Turki, I. Mehri, I. Fhoula, A. Hassen, H..Ouzari // World J. Microbiol. Biotechnol. – 2014. – V.30. – No1. – P. 87-98 DOI: 10.1007/s11274-013-1414-1.