МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ ШТАММОВ БАКТЕРИЙ ТРЕХ ВИДОВ, ВЫДЕЛЕННЫХ ОТ ИНДЕЕК И КУР

Научная статья
DOI:
https://doi.org/10.23649/jae.2020.4.16.5
Выпуск: № 4 (16), 2020
Опубликована:
14.12.2020
PDF

Аннотация

В материале представлены данные об идентификации штаммов бактерий, выделенных у индеек и кур. В работе были использованы изоляты псевдомонад, асинетобактерий и кишечной палочки. Последние были выделены у индеек, а предыдущие у кур. Поиск in-silicoдал возм ожность предложить ряд ферментов для генотипирования изолятов асинетобактерий, а генотпирование изолятов псевдомонад и кишечной палочки проводилось с использованием ранее подобранных ферментов. Показано, что для асинетобактерий оптимальной сочетанностью обладают ферменты SgsI и Eco47III, которые показывают 100% активность в одном буфере. Псевдомонады генотипировали с помощью пары ферментов BcuI/StuI, были выявлены два генетически отличающихся штамма, два изолята были идентичными (органы одной особи). У 21 изолята кишечнгой палочки с использованием пары ферментов XbaI/PstI выявили 17 штаммов, а при использовании пары XhoI/BsuRI – 16 штаммов. Индекс дискриминации, показывающий способность метода разделять штаммы, не применяли, т.к. он может использоваться исключительно на эпидемиологически не родственных изолятах. В данном случае, индейки содержались в условиях одного хозяйства, отбор проб проводился в одно время, поэтому нельзя исключить возможность перезаражения птицы.

Полный текст только в pdf

Список литературы

  • Tapalsky D.V. Fenotipicheskoe i molekulyarno-geneticheskoe tipirovanie sal`monell: realii i perspektivy [Phenotypical and molecular-genetic typing of salmonellae: reality and prospects] / D.V. Tapalsky, V.A. Osipov, S.V. Zhavoronok // Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. – 2005. – No 6. – P. 88-93 [in Russian]

  • Terletskiy V.P. Effektivnyj molekulyarno-geneticheskij metod identifikaczii shtammov salmonell i proteya [The efficient molecular genetic technique for identification of Salmonella and Proteus strains] / V.P. Terletskiy, V.I. Tyshchenko, O.B. Novikova, A.N. Borisenkova, D.E. Belash, A.F. Yakovlev // Russian Agricultural Sciences. – 2013. – No 5. – P. 60-63. [in Russian]

  • Bikandi J. In silico analysis of complete bacterial genomes: PCR, AFLP-PCR, and endonuclease restriction / J.Bikandi, R.San Millán, A. Rementeria, J. Garaizar // Bioinformatics. – 2004. – V. 22. – P. 798-799.

  • Gibson J.R. Comparison of PFGE, ribotyping and phage-typing in the epidemiological analysis of Campylobacter jejuni serotype HS2 infections / J.R. Gibson, C. Fitzgerald, R.J. Owen // Epidemiol. Infect. – 1995. – V. 115. – No 2. – P. 215-225.

  • Lartigue M.F. Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry for bacterial strain characterization / M.F. Lartigue // Infect. Genet. Evol. – 2013. – V. 13. – P. 230-235.

  • Meisel S. J. Raman Spectroscopy as a Potential Tool for Detection of Brucella spp. in Milk / S. Meisel, S. Stöckel, M. Elschner, F. Melzer, P. Rösch, J. Poppa // Appl. Environ. Microbiol. – 2012. – V. 78. – No16. – P. 5575-5583.

  • Minharro S. Biotyping and genotyping (MLVA16) of Brucella abortus isolated from cattle in Brazil, 1977 to 2008 / S. Minharro J.P. Silva, E.M. Dorneles, R.B. Pauletti, H. Neubauer, F. Melzer, F.P. Poester, M.G. Dasso, E.S. Pinheiro, P.M. Soares, R.L. Santos, M. Heinemann A.P. Lage // PLoS ONE. – 2013. – V.8. – No12: e81152. doi:10.1371/journal.pone.0081152.